2029، ژاپن در آینده نزدیک. سایبورگ کامل Motoko Kusanagi یک گروه ضربتی را متصور است که به طور پیشگیرانه به تهدیدات در حال ظهور حمله می کند. او و تیمش توسط دایسوکه آراماکی به عنوان بخش امنیت عمومی 9، با نام "جوخه شل" شناسایی می شوند. یک توطئه بین المللی به یک هکر معروف به "مستر عروسک" اشاره می کند. چه سرنوشتی در انتظار کوساناگی است؟ پایان بازی هکر چیست؟ دوره جدیدی از اکشن سایبرپانک آغاز می شود!